La TVB est identifiée et mise en œuvre à différentes échelles territoriales qui s’articulent à travers des relations d’opposabilité.
Les SRCE, de même que les schémas régionaux d’aménagement dans les DOM et le plan d’aménagement et de développement durable en Corse, doivent prendre en compte les orientations nationales pour la préservation et la remise en bon état des continuités écologiques (ONTVB).
Les ONTVB s’imposent également aux documents de planification et projets relevant du niveau national notamment aux grandes infrastructures linéaires de transport de l’Etat et de ses établissements publics, dans un rapport de compatibilité (article L. 371-2 du code de l’environnement).La compatibilité avec les ONTVB « s'apprécie notamment au regard des atteintes susceptibles d'être portées aux espaces constitutifs de la trame verte et bleue en application de l'article L. 371-1 ainsi qu'aux espèces, habitats et continuités écologiques Trame verte et bleue – Questions Réponses – Janvier 2014 21/36d'importance nationale identifiés comme constituant des enjeux nationaux et transfrontaliers par le document-cadre adopté en application de l'article L. 371-2 ». Ainsi, les enjeux de cohérence nationale des ONTVB (listes d’espèces/habitats, des espaces protégés et continuités écologiques d’importance nationale) sont à intégrer dans l’application de la séquence « éviter, réduire, compenser » de l’évaluation environnementale des documents et dans l’étude d’impact des projets relevant du niveau national.
Au niveau local, prennent en compte le SRCE (article L. 371-3 du code de l’environnement) :
La notion d'« opposabilité » recouvre différents types de rapports juridiques entre des normes. On peut identifier trois niveaux d’opposabilité entre une norme dite supérieure et une norme dite inférieure, du plus contraignant au moins contraignant :