La biodiversité et les milieux naturels (sept ZNIEFF, une bordure littorale au nord et un massif forestier au sud) font partie intégrante de la commune des Loges. Suite à la modification du Plan d'Occupation des Sols (POS), en 2007 et en 2008, le conseil municipal de la commune a veillé, au moment de l'élaboration de son PLU, à ce que la Trame verte et bleue (TVB) soit intégrée de manière pertinente, en faisant même un atout pour l'aménagement de son territoire.
Son identification dans le PLU a permis de répondre aux problématiques spécifiques de la commune des Loges comme la présence de cavités souterraines, le ruissellement, les clos-masures (fermes fortifiées par leurs talus plantés d'arbres de haut jet), les prairies jardinées mais aussi « la ceinture verte » autour du bourg. L'ensemble de ces enjeux a été pris en compte comme élément de la TVB locale. Les îlots de biodiversité existants et déjà caractérisés ont par la suite été ajoutés. Par ailleurs, l'identification de la TVB a permis la mise en place d’une stratégie pour la maîtrise de l'étalement urbain sur le territoire de la commune.