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Les ouvrages hydrauliques sont en grande partie responsables de la perturbation de la continuité écologique, notion développée par la Directive Cadre sur l’Eau, définie comme la libre circulation des organismes vivants tout au long de leur cycle de vie (alimentation, reproduction et repos) et le bon déroulement du transport sédimentaire.
Ce guide est le fruit de discussions et d'échanges qui ont permis de confronter diverses expériences et de retenir les aspects les plus pratiques des connaissances acquises sur ces milieux. Il présente donc des savoirs de terrain et des savoirs bioécologiques qui se complètent afin d'aboutir à une optimisation dans la gestion des ouvrages vis-à-vis des poissons migrateurs et plus particulièrement de l'anguille en zone littorale et estuarienne.