De par leur emprise sur les milieux naturels et leur effet barrière, les infrastructures linéaires de transport ont un impact majeur sur le fonctionnement écologique des milieux et des espèces qui les utilisent. Qu’ils s’agissent de grandes espèces comme les ongulés ou de plus petites (amphibiens, insectes …), qu’elles soient terrestres (ex : petits carnivores) ou volantes (oiseaux, chauves-souris), toutes les espèces peuvent potentiellement être affectées.